SWISS-MODEL & PyMOL

Hands-on prediction and visualization of protein structure Please note that the prediction of protein structure is generally very difficult and depends much on the amount of data of similar proteins stored in PDB (Protein Data Bank). Predi…

ripgrep-allでどこかに保存した論文を探す

初めてblogっぽいことを書いてみる。 最近TL上でたまに流れてきて気になってはいたものの、podcastなるものにあまり馴染みがなく敬遠していたが、テーマにそそられて思い切って聞いてみた。 researchat.fm 2時間とめちゃくちゃ長いが、人の声に飢えているの…

Juliaのファイル操作

書き込み #書き込み(上書き) julia> iow = open("text.txt","w") julia> write(iow,"Hello world") julia> close(iow) #書き込み(追記) julia> ioa = open("text.txt","a") julia> write(ioa,"Append world") julia> close(ioa) doブロックを使えば自動…

JuliaからRを使う

やはりggplotを使いたいという時がある. ]でパッケージモードに入り, addで追加. (v1.4) pkg> add RCall julia> using RCall, Distributions, Random, DataFrames julia> Random.seed!(0) MersenneTwister(UInt32[0x00000000], Random.DSFMT.DSFMT_state(Int…

Julia特有の構文メモ2

ライブラリ Juliaの関数は大きく3つに分けられる. コアベースの関数 標準ライブラリの関数 外部ライブラリの関数 コアベースの関数 Core.関数 Core.ifelse 判定文が真なら1つ目、偽なら2つ目の引数を返す. julia> Core.ifelse('a' < 'A', 'a', 'A') 'A': ASC…

Julia特有の構文メモ

Symbol Symbol("test") #のように使う 文字列を表すが、Symbolは常に同じオブジェクトであることが保証されるため、メモリ効率がいい. DataFrameのラベル名などに使われる. ショートカット構文 条件 || 実行文 #左辺が偽のときだけ実行される 条件 && 実行文…